Najšire prihvaćena hipoteza u vezi s mehanizmom formiranja flokula aktivnog mulja je premosni učinak ekstracelularnih polimera i filamentoznih bakterija. Stoga se problem-odvajanja vode u sistemima aktivnog mulja može objasniti i sa sljedećih aspekata:
1. Disperzovani rast
Općenito se vjeruje da je raspršeni rast, također poznat kao anti- flokulacija ili dezintegracija mulja, uglavnom zbog nedostatka ekstracelularnih polimera ili interferencije sa efektom premošćavanja ovih polimera, sprječavajući mikroorganizme aktivnog mulja da se prianjaju zajedno. Faktori koji mogu dovesti do raspršenog rasta uključuju: prekomjeran rast ne-bakterija koje ne flokuliraju; nizak odnos dvovalentnih katjona (npr. jona kalcijuma i magnezijuma) prema monovalentnim kationima (joni kalijuma i natrijuma); anti{5}}efekat biosurfaktanata; trovanje muljem zbog unošenja toksina; naglo povećanje omjera F/M uzrokovano udarnim opterećenjima ili gubitkom mulja; i velike površine -kiseljavanja i dezintegracije anaerobnog mulja u rezervoaru za aeraciju.
Takve flokule se jako razlikuju po veličini; veće flokule brzo tonu, dok manje flokule tonu sporo, formirajući diskontinuirani sloj sa zamućenim supernatantom.
2. Fluke mulja u obliku igle
Kada flokule aktivnog mulja sadrže samo bakterije slične floku-i bez filamentnih bakterija, one su obično vrlo male (do 75 µm), labave i lomljive. Ove flokule se zovu igličaste flokule u obliku igle.
Kada je bioflokulacija neefikasna, ove flokule se lako režu u fragmente turbulentnim strujanjem u rezervoaru za aeraciju, posebno kada se koristi mehanička aeracija ili difuzori velikih mehurića. Osim toga, razne pumpe, gravitacijske brane i vijugave cijevi mogu stvoriti turbulenciju, dalje razbijajući ove kosine u male komadiće. Kada je opterećenje muljem (F/M) prenisko, starenje mulja također može dovesti do igličastih nakupina mulja-.
Ove flokule se značajno razlikuju po veličini; veće flokule se talože brzo, dok se manje flokule talože sporo, formirajući diskontinuirani sloj sa zamućenim supernatantom.
3. Raštrkane suspendirane flokule
Ponekad se na površini sekundarnog taložnika mogu vidjeti labave flokule, ali efluent ostaje bistar. Ispitivanja taloženja su pokazala da je brzina taloženja mulja bila spora. Ova pojava se naziva labava suspenzija floka. Glavni razlog je taj što je opterećenje muljem (F/M) previsoko, mikroorganizmi aktivnog mulja su u logaritamskoj fazi rasta, što rezultira visokim nivoom energije u aktivnom mulju, snažnom mikrobnom aktivnošću, labavom teksturom mulja, slabim formiranjem flokula i poteškoćama u taloženju. Kada se opterećenje mulja na odgovarajući način smanji, labave flokule mogu nestati.